Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdk5P49615 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdk5P49615 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdk5P49615 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5P49615 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5P49615 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5P49615 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5P49615 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5P49615 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5P49615 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5P49615 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5P49615 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5P49615 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5P49615 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdk5P49615 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdk5P49615 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5P49615 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5P49615 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5P49615 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5P49615 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5P49615 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5P49615 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdk5P49615 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms