Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PtpreP49446 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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PtpreP49446 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtpreP49446 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PtpreP49446 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PtpreP49446 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PtpreP49446 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpreP49446 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpreP49446 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PtpreP49446 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PtpreP49446 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PtpreP49446 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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PtpreP49446 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PtpreP49446 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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PtpreP49446 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtpreP49446 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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