Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gbx2P48031 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms