Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl13P47963 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl13P47963 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms