Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gli1P47806 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gli1P47806 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms