Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nedd4P46935 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nedd4P46935 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms