Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klf1P46099 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klf1P46099 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms