Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syt1P46096 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms