Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdx2P43241 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms