Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nkx1-2P42580 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkx1-2P42580 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms