Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Elk1P41969 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elk1P41969 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms