Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ighmbp2P40694 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms