Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vps26aP40336 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms