Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csf3rP40223 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csf3rP40223 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms