Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lig1P37913 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms