Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly6fP35460 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ly6fP35460 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms