Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Grin1P35438 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin1P35438 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Grin1P35438 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Grin1P35438 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms