Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TpoP35419 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TpoP35419 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TpoP35419 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TpoP35419 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpoP35419 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpoP35419 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpoP35419 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpoP35419 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpoP35419 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpoP35419 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpoP35419 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpoP35419 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpoP35419 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpoP35419 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TpoP35419 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpoP35419 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TpoP35419 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TpoP35419 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TpoP35419 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TpoP35419 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TpoP35419 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TpoP35419 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TpoP35419 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms