Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sftpa1P35242 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms