Protein–RNA interactions for Protein: P32115

Pax4, Paired box protein Pax-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax4P32115 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax4P32115 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax4P32115 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax4P32115 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pax4P32115 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms