Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc11P31313 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms