Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hoxc10P31257 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms