Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VtnP29788 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VtnP29788 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VtnP29788 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
VtnP29788 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VtnP29788 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VtnP29788 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VtnP29788 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms