Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nedd8P29595 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms