Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtgfP29268 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtgfP29268 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtgfP29268 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtgfP29268 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms