Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprmP28828 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PtprmP28828 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprmP28828 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprmP28828 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PtprmP28828 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprmP28828 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprmP28828 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
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