Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrbP28704 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrbP28704 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RxrbP28704 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrbP28704 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrbP28704 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RxrbP28704 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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