Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RxraP28700 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
RxraP28700 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RxraP28700 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RxraP28700 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RxraP28700 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RxraP28700 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RxraP28700 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RxraP28700 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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