Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BgnP28653 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BgnP28653 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BgnP28653 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BgnP28653 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BgnP28653 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BgnP28653 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BgnP28653 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BgnP28653 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BgnP28653 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BgnP28653 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BgnP28653 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BgnP28653 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BgnP28653 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BgnP28653 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms