Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Xrcc5P27641 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Xrcc5P27641 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms