Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
U2af2P26369 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U2af2P26369 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms