Protein–RNA interactions for Protein: P25976

Ubtf, Nucleolar transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbtfP25976 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UbtfP25976 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UbtfP25976 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UbtfP25976 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UbtfP25976 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UbtfP25976 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UbtfP25976 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms