Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Lmo2P25801 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Lmo2P25801 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms