Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NdnP25233 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
NdnP25233 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
NdnP25233 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
NdnP25233 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
NdnP25233 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms