Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Plgrkt-208ENSMUST00000143467 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm31123-201ENSMUST00000192094 666 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 AC133498.1-203ENSMUST00000221213 668 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Plac1-202ENSMUST00000114843 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd11P23813 Gm29353-201ENSMUST00000185801 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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