Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxd8P23463 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxd8P23463 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms