Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3aP23116 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms