Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk1P22518 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms