Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P20040 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P20040 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
P20040 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
P20040 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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