Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cox5bP19536 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cox5bP19536 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms