Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps6ka3P18654 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms