Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18530 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P18530 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18530 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18530 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18530 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
P18530 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P18530 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
P18530 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
P18530 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
P18530 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms