Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnaP17918 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PcnaP17918 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms