Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Irf1P15314 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Irf1P15314 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms