Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ctla2aP12399 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ctla2aP12399 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms