Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Itga5P11688 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms