Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd4P10628 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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