Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nid1P10493 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms