Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl2P10148 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl2P10148 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms