Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Schip1P0DPB4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms